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In der Zwischenzeit bereiten sich Woolsey und [[Doktor|Dr.]] [[Jennifer Keller]] auf ein Treffen mit [[Todd|Todd's]] [[Hive]] vor. [[Ronon]] besteht darauf mitzukommen, angeblich um Jennifer besser beschützen zu können. Als sie sich gerade auf den Weg machen begegnen sie Daniel und Rodney, die auf dem Weg zum mysteriösen Gang sind. Rodney findet wenig gefallen daran, dass Ronon Jennifer begleitet, wird aber von Daniel aus seinen Gedanken gerissen.

Sie finden in dem Gang drei Löcher in denen normalerweise Leuchten stecken. Daniel will die Leuchten unbedingt finden, da er der Meinung ist, dass sie der Schlüssel sind. Also suchen Rodney und er in einem Katalog nach ihnen in dem alle Gegenstände gelistet sind die bei Aufräumungsarbeiten gefunden wurden. Die Leuchter wurden wegen einer Überschwemmung von Atlantis in einem Lagerraum zwischengelagert. Sie finden die Leuchter dort auch. Beim Einsetzen  geben sie unterschiedliche Töne von sich. Daniel und Rodney vermuten, dass es sich dabei um eine Art Code handelt.

Auf der [[Daedalus]] wird derweil Todd in Empfang genommen. Nachdem Woolsey's Rede übergangen wurde arbeiten Jennifer und Todd im Labor an der Therapie die es [[Wraith]] möglich machen soll normale Lebensmittel zu essen ({{Ep|SGA|5x08}}). Todd ist trotz der erfolgreichen Simulationen nicht von der Wirksamkeit überzeugt, sieht aber den Nutzen für beide Seiten.

In Atlantis arbeiten Rodney und Daniel noch immer an der Entschlüsselung der Daten als sich über dem Ozean ein [[Hyperraumfenster]] unbekannter Herkunft öffnet. Im Kontrollraum herrscht Verwirrung und Sheppard wird in den Kontrollturm gerufen. Das [[Raumschiff|Schiff]] der Fremden hält auf Atlantis zu und Sheppard will die [[Jumper]] starten lassen. Als [[Zelenka|Radek]] ihn darauf hinweist, dass ihnen nur noch zehn Sekunden bleiben, und damit viel zuwenig Zeit um die Jumper in die Luft zu bringen, lässt er die Schilde aktivieren, das Schiff fliegt aber einfach hindurch.

[[Bild:Alien 5x10.jpg|200px|thumb|left|Die drei Aliens]]Als drei Aliens in ziemlich robust aussehenden Anzügen aus dem Schiff abspringen machen sich Sheppard und [[Teyla]] mit einem Team auf den Weg sie aufzuspüren. In einem Korridor treffen die beiden Gruppen dann aufeinander. Bevor Sheppard's Team etwas tun kann haben die Aliens eine Art Plattform aus drei Platten errichtet, die sie auf dem Rücken getragen haben. Kurz bevor sie angegriffen werden spannt sich ein Schild über die Plattform und die Plattform bohrt sich bis ganz herunter in den Gang in dem das geheime Labor entdeckt wurde indem sie Löcher in alle Decken stanzt. Bevor Sheppard, Teyla und die [[Marines]] den Weg nach unten hinter sich gebracht haben dringen die Aliens in das Labor ein, nehmen das Gerät mit, welches sich aktiviert hat, entführen Daniel und Rodney und fliegen mit der Plattform wieder nach oben direkt zu ihrem Raumschiff. Dabei wird aber ein Alien angeschossen das mit einem Schutzschild, das an seinem Arm haftet, die anderen vor den im letzten Moment eingetroffenen Trupp von Sheppard schützt. Nachdem eine Anzahl Kugeln das Schild getroffen hat bricht dieses zusammen und das Alien fängt einige Kugeln ein.

Sheppard weist Radek an, den Alien zu untersuchen, den sie getroffen haben. Radek kann vor Ort nichts über den Alien sagen, nur dass es höchst wahrscheinlich tot ist. Er schafft es auf die Krankenstation, muss aber feststellen das ein EM-Feld des Anzugs jegliche Scans verhindert. Kurzentschlossen beschließt Sheppard den Anzug aufzuschneiden. Zuerst versucht Radek es mit einer kleinen Fräse in der Bauchgegend des Aliens, der Anzug lässt sich davon allerdings, im Gegensatz zu der nun stumpfen Klinge, nicht beeindrucken. Sheppard schlägt vor es am Hals zu versuchen und zusammen mit einer grösseren Fräse sieht das Unternehmen gut aus bis ein blinkendes Licht am Anzug die Selbstzerstörung ankündigt und man sich aus dem Raum zurückzieht bevor der Anzug explodiert.