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[[Bild:Labor Daniel Mckay.jpg|200px|thumb|left|Daniel und Rodney mit Sheppard im geheimen Labor]][[Rodney McKay]] streitet mit [[John Sheppard]] darüber, ob nun jeder Besucher auf Atlantis zu begrüßen und ihm die Hand zu schütteln sei. Sie treffen im Gateraum [[Woolsey]], welcher bereits wartet. Auf seine Anweisung hin wird [[Daniel Jackson]] von der [[Daedalus]] nach [[Atlantis]] [[Asgard-Transporter|gebeamt]].

Daniel erklärt, dass er ein geheimes Labor von [[Janus]] suche. McKay lässt sich von dieser Idee nicht im gleichen Maße mitreißen, aber Daniel findet in der Datenbank den Eintrag eines Assistenten des Janus, laut dem Janus in einem Gang „verschwunden“ ist.

In der Zwischenzeit bereiten sich Woolsey und [[Doktor]] [[Jennifer Keller]] auf das bevorstehende Treffen mit [[Todd]]s [[Basisschiff]] vor. [[Ronon]] besteht darauf mitzukommen und begründet das damit, dass er Keller dann besser beschützen könne. Als sie sich auf den Weg begeben, treffen sie unterwegs Daniel und Rodney, die den im Eintrag beschriebenen Gang suchen. McKay ist sichtlich abgeneigt, dass Ronon Jennifer begleitet, wird aber von Daniel aus seinen Gedanken gerissen.

Sie finden an den Wänden des Ganges drei Löcher, in denen ursprünglich Leuchten steckten. Daniel will diese Leuchten unbedingt finden, da er der Meinung ist, dass sie der Schlüssel zum Eintritt ins Labor sind. Also suchen Rodney und er in einem Katalog nach ihnen, in dem alle während der Aufräumarbeiten gefundenen Gegenstände gelistet sind, denn die Leuchten wurden wegen einer Überschwemmung in einem Lagerraum deponiert. Beim Einsetzen geben sie unterschiedliche Töne von sich, weswegen Daniel und Rodney vermuten, dass es sich um eine Art Code handelt.

[[Bild:Pegasus-Asgard-Shield.png|200px|thumb|left|Alien mit Schutzschild]]Nach einigen Experimenten finden die beiden heraus, dass man alle drei direkt nacheinander berühren muss, damit die Frequenz des entstehenden Tons eine Wand durchlässig werden lässt, durch die man in [[Janus' geheimes Labor]] gelangt. Neben den normalen Lichtern, die wie üblich beim Betreten eines Raumes in Atlantis aufleuchten, aktiviert sich auch ein anderes Gerät, was keinem der beiden auffällt. Auf einem unbekannten anderen Planeten wird dadurch zeitgleich eine zweite Maschine aktiviert und ein davor stehendes Wesen in einem [[Exoskelett]] befiehlt, den anderen Bescheid zu sagen - das Gerät sei aktiviert worden. Sheppard, der während der Abwesenheit von Woolsey das Kommando in Atlantis hat, sieht sich das Labor an. Rodney hat bereits dafür gesorgt, dass die Wand konstant „offen“ bleibt, in dem er ein Gerät aufgestellt hat, das ständig die benötigten Ultraschall-Frequenzen abgibt. Er erklärt, dass Janus die Daten mit etlichen Verschlüsselungen versehen hat und beginnt mit Daniel damit diese zu knacken.

In Atlantis arbeiten Rodney und Daniel noch immer an der Entschlüsselung der Daten, als sich über dem Ozean ein [[Hyperraumfenster]] öffnet. Im Kontrollraum herrscht Verwirrung und Sheppard wird in den Kontrollturm gerufen. Das [[Raumschiff (SGA 5x10)|Schiff]] der Fremden hält auf Atlantis zu und John will die [[Jumper]] starten lassen. Als [[Radek Zelenka|Radek]] ihn jedoch darauf hinweist, dass ihnen nur noch zehn Sekunden bleiben, und damit viel zu wenig Zeit, um die Jumper in die Luft zu bringen, lässt er die Schilde aktivieren. Zum Erstaunen aller Anwesenden fliegt das Schiff jedoch einfach hindurch.

[[Bild:Alien 5x10.jpg|200px|thumb|left|Die drei Aliens]]Als drei Aliens in Exoskeletts aus dem Schiff abspringen, machen sich Sheppard und [[Teyla]] mit einem Team auf den Weg sie aufzuspüren. In einem Korridor treffen die beiden Gruppen dann aufeinander. Bevor Sheppards Team handeln kann, haben die Aliens eine Art Plattform aus drei Platten errichtet, die sie auf dem Rücken getragen haben. Kurz bevor sie angegriffen werden, spannt sich ein Schild über die Plattform und die Plattform bohrt sich nach unten durch die Stockwerke bis zum Gang, in dem das geheime Labor entdeckt wurde. Bevor Sheppard, Teyla und die [[Marines]] den Weg nach unten hinter sich gebracht haben, dringen die Aliens in das Labor ein, nehmen das bei Rodneys und Daniels Ankunft aktivierte Gerät mit und betäubten Daniel und Rodney. Als der Soldatentrupp mit Sheppard eintrifft, aktiviert der ihnen am nächsten stehende Außerirdische einen Schild durch seinen Anzug, den die abgefeuerten Projektile der Soldaten nicht durchdringen können. Als die beiden anderen Eindringlinge Rodney und Daniel mitnehmen, auf die Plattform steigen und durch sie wieder nach oben in ihr Raumschiff fliegen, fällt der Schild aus und der verbliebene Außerirdische wird niedergeschossen, während das Raumschiff in den Hyperraum fliegt.

Sheppard weist Radek an, den Außerirdischen zu untersuchen, den sie getroffen haben. Dieser aber kann vor Ort nichts genaueres sagen, außer dass er höchstwahrscheinlich tot ist. Anschließend wird der Außerirdische auf die Krankenstation transportiert, allerdings verhindert ein EM-Feld des Anzugs jegliche Scans. Kurzentschlossen beschließt Sheppard den Anzug aufzuschneiden und nach einigen vergeblichen Versuchen am Bauchbereich schlägt Sheppard vor, es am Hals zu versuchen. Tatsächlich funktioniert es so, allerdings aktiviert sich plötzlich ein blinkendes Licht am Anzug, die Selbstzerstörung ankündigend. Sheppard lässt sofort alle aus dem Raum fliehen, bevor der Anzug explodiert.

Auf der Daedalus wird Todd von einem seiner Basisschiffs gerufen. Ein Stützpunkt seiner Allianz wird von einer rivalisierten Fraktion angegriffen und zwei von drei Schiffen machen sich auf den Weg dorthin. Anstatt jedoch normal in den Hyperraum einzutreten, lösen sich die Schiffe beim Eintritt in das Hyperraumfenster sofort auf. Todd ist geschockt und der Meinung, die Menschen wären dafür verantwortlich. Woolsey kommt überhaupt nicht wirklich dazu, das abzustreiten, bevor Todd zwei [[Wraith-Betäubungsstäbe]] zieht und jeden in seiner Umgebung sofort betäubt. Dann verriegelt er sämtliche Türen und beamt sein Gefolge auf die Daedalus: Er hat das Schiff übernommen.