Atlantis ist eine Stadt, die einst von den Antikern, den Erbauern der Stargates, errichtet wurde. Die Stadt befand sich zunächst auf der Erde, genauer gesagt in der Antarktis, die zu dieser Zeit noch nicht vollständig von Eis bedeckt war. Da Atlantis eigentlich ein riesiges intergalaktisches Stadtschiff ist, siedelten sich die Antiker später in der Pegasus-Galaxie an. Sie verließen Atlantis wegen des Angriffs der Wraith und erst 10.000 Jahre später entdeckten die Menschen es wieder.