Eli Wallace spielt ein Computerspiel und löst dabei ein schwieriges Mathematisches Problem. Obwohl er sich sicher ist das Problem richtig gelöst zu haben wird er aber einfach nur an den Anfang des Levels zurück gesetzt. Kurz darauf stehen General Jack O'Neil und Doktor Nicholas Rush vor Elis Tür. Eli ist verwirrt und überrascht als Doktor Rush im erklärt man sei hier weil er das Problem im Spiel gelöst habe. Er bittet ihn eine Geheimhaltungserklärung zu unterzeichnen. Eli nimmt die Erklärung möchte sie aber zuerst mit seiner Mutter besprechen. O'Neil erklärt sie würden ihn auf ihr Raumschiff beamen und genau das geschieht kaum das Eli wieder im Haus ist. Doktor Rush erklärt Eli das sie sich auf der General Hammond befinden und sie mit dieser zu einem 21 Lichtjahre entfernten Planeten fliegen würden. Eli stimmt zu und während des Fluges erhält er Informationen über das Stargate. Unter anderem erfährt er das man seit 2 Jahren auf der Ikarus Basis versucht eine Adresse aus neun Chevrons zu wählen welche man in der Antikerdatenbank gefunden hat.
Als die Hammond die Basis erreicht wird Eli zusammen mit Senator Armstrong dessen Tochter Chloe und Doktor Rasch hinuntergebeamt. In der Basis versucht man das Stargate mit der neun Chevron Adresse und Elis Lösung zu aktivieren. Der Versucht scheitert und Doktor Rush und Eli versuchen das Problem zu finden. Eli meint die Adresse könnte falsch sein aber Doktor Rush erklärt es gebe nur diese eine Adresse. Plötzlich erscheint eine Angriffsflotte der Luzianer Allianz und greift die Basis an. Zwar kann die Hammond die Ha'tak aufhalten aber ein Truppentransporter und eine Reihe von Todesgleitern gelingt der Durchbruch. Sie eröffnen das Feuer auf die Basis und der Zugang wird dabei zerstört. Durch den Angriff gerät die Antiker Energiequelle in einen kritischen Zustand so das sie explodieren wird. Eli überzeugt das die Adresse nicht richtig ist und Rush entschließt sich zu einem neuen Versuch. Er lässt die Anwahl der Erde stoppen und wählt erneut die neun Chevron Adresse, diesmal aber mit der Erde als Ursprungssymbol. Das Stargate öffnet sich, lässt sich aber nicht mehr schließen und die Energiequelle steht kurz vor der Explosion. Colonel Young befiehlt daher das alle durch das Gate gehen sollen mit soviel wie möglich Ausrüstung. Young, der noch einige Kommunikationssteine mit nimmt, verlässt als letzter die Basis direkt danach explodiert der Planet und zerstört dabei auch die Raumschiffe der Angreifer.
Die Menschen landen in einem verlassen Stargateraum wobei das Stargate anders aussieht als die bisher bekannten Gates. Die Ankommenden werden aus dem Stargate geschleudert so das einige sich bei der Landung verletzen. Als letzter erscheint Colonel Young welcher mehre Meter durch den Raum fliegt und mit einer schweren Kopfverletzung liegen bleibt. Nach seinem erscheinen bricht die Stargateverbindung ab. Während die Menschen noch versuchen sich zu orientieren kommt es zu einem merkwürdigen Verzerrungseffekt. First Lieutenant Matthew Scott und Eli suchen Doktor Rush und finden ihn auf einer Aussichtsplatform. Sie erkennen das sie sich auf einem Schiff der Antiker befinden das sich mit Überlichtgeschwindigkeit bewegt. Das Lebenserhaltungssystem arbeitet nicht richtig aus und Doktor Rush versucht es zu reparieren. Die ersten Versuche scheitern und bei der Suche nach einer Lösung stößt man auf eine Karte die zeigt das das Schiff von der Erde gestartet wurde aber nun mehre Galaxien weit entfernt ist.
Man entschließt sich das Raumschiff in mehreren Gruppen zu untersuchen. Sie entdecken das die Hülle des Raumschiffs an mehreren Stellen beschädigt ist und das vermutlich durch eines der Lecks Luft entweicht. Während dessen findet Doktor Rush die Kommunikationssteine und setzt sie heimlich ein. Er übernimmt Bill Lee im Stargate Center. Danach erklärt er den anderen das General O'Neil ihn zum Leiter ernannt hat und man versuchen solle das Schiff zu reparieren. Die Menschen sind aufgebracht weil sie nach Hause wollen. Nur das Eingreifen von Lieutenant Matthew Scott kann die Leute beruhigen. Man untersucht weiter das Schiff und Eli entdeckt fliegende Kameras, eine Antiker Art des M.A.L.P.. Doktor Rush findet schließlich heraus das die CO2 Filter defekt sind.