Die Flaggschiffe der Systemlords sind größer und mächtiger als Ha'taks. Sie besitzen mehr Waffen, verbesserte Schilde und mehr Todesgleiter. Vor allem dienen sie zur Demonstration der Macht der Goa'uld. Nur wirklich mächtige Systemlords besitzen ein Flaggschiff.
Systemlords, die Flagschiffe besaßen:
- Ra, Flaggschiff (Ra)
- Anubis, Flaggschiff (Anubis)
- Apophis, Flaggschiff (Apophis)
- Heru'ur, Flaggschiff (Heru'ur)
- Ba'al, Flaggschiff (Ba'al)
- Sokar, Flaggschiff (Sokar)
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