Bill Lee ist ein Wissenschaftler im Stargate-Center, der schon an den unterschiedlichsten Projekten mitgewirkt hat. Er tauchte zum ersten Mal in der Episode "Das Wunder" auf und war auf dem Alpha-Stützpunkt für die Erforschung des Planeten eingeteilt. In "Evolution" begleitete er Dr. Jackson nach Honduras, wo sie ein altes Antiker-Artefakt zu finden hofften. Sie wurden von Rebellen gefangengenommen und über die Grenze nach Nicaragua verschleppt.
In der 8. Staffel untersuchte Lee eine außerirdische Pflanze, die sich über das Labor hinaus ausbreitete und den gesamten Stützpunkt infizierte sowie die Energieversorgung einen gazen Tag lang unterbrach. Nach intensiver radioaktiver Bestrahlung ließ sich das Gewächs jedoch vernichten. In der 9. Staffel arbeitete er mit dutzenden Carters und Martouf zusammen, um ein Problem mit dem Stargate zu lösen, durch das viele verschiedene Versionen des SG-1-Teams auf die Erde gelangten. Seine Theorien erwisen sich jedoch alle als ungeeignet zur Behebung der Störung. Ebenfalls war er an Col. Carters Untersuchung einhes Antikergeräts aus England beteiligt. Dabei versetzte er jedoch Daniel, zusätzlich zu Carter und Mitchell, die bereits verschwunden waren, in eine parallele Dimension. Er konnte das Problem letzten Endes jedocxh nicht erkennen und glaubte an ihre Miniaturisierung, woraufhin er das Labor absperren und mit Lupen nach den dreien suchen ließ. Auch diese Vermutung erwies sich als Irrtum.
Aufgrung der zahlreichen verschiedenen Aufgaben, mit denen Lee bisher betraut worden ist lässt vermuten, dass er ein Allrounder, also ein Allgemeinwissenschaftler ist. Wenn auch seine Kenntnisse auf vielen Gebieten lückenhaft sind und er viele Probleme selbst verursacht, so ist er doch ein wichtiges Mitglied im wissenschaftlichen Stab des Stargate-Kommandos.